De 2004 BMW R1100S BoxerCup Replika is een speciale editie ter ere van de raceversie. In tegenstelling tot het basismodel heeft hij een nieuw ontworpen voorkant die een nog grotere hellingshoek mogelijk maakt, een Laser-uitlaatsysteem als standaard, een eenpersoonszit, een sportief ophangingspakket, een driekleurige lak met de BMW Motorsport kleuren en diverse kleine aanpassingen en modificaties voor betere prestaties. De standaard motor is een luchtgekoelde boxer-tweecilinder-viertaktmotor van 1085 cc met een zesversnellingsbak die een geclaimd vermogen van 98 pk en een koppel van 97 Nm levert.
Dit exemplaar is nieuw in Duitsland geleverd en in 2006 met een kilometerstand van circa 3.000 naar Nederland gehaald.